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(Seminar)高性能分子动力学模拟软件eMD的设计及其研发进展
05/31
2018
- Title (Seminar)高性能分子动力学模拟软件eMD的设计及其研发进展
- Speaker
- Date
- Venue
Abstract
| CAS Key Laboratory of Theoretical Physics | |
| Institute of Theoretical Physics | |
| Chinese Academy of Sciences | |
| Seminar | |
| Title 题目 | 高性能分子动力学模拟软件eMD的设计及其研发进展 |
| Speaker 报告人 | 徐顺 |
| Affiliation 所在单位 | 中国科学院计算机网络信息中心 中国科学院计算科学应用研究中心 |
| Date 日期 | 2018年5月31日（周四）10:00 |
| Venue 地点 | Conference Room 322, ITP main building |
| Abstract 摘要 | 分子动力学模拟方法在计算物理和计算化学等相关研究中广泛使用，其计算模拟软件也存在多种形式如LAMMPS、NAMD和HOOMD-blue等等。本报告首先分析当前分子动力学模拟软件的现状，提出自主研发分子动力学模拟软件eMD的目标定位，主要介绍eMD的架构设计、典型应用和研发进展，最后还将介绍在国产“申威”处理器上eMD软件开发相关工作。eMD为一款面向高性能并行计算环境的分子动力学模拟软件，基于异构计算加速的分子动力学模拟软件架构Moly，面向生物大分子和纳米材料研究中分子模拟计算应用，以开放的软件架构设计统一分子动力学模拟中建模、计算和分析三大步骤。软件着重在模拟力场设计、异构计算框架、增强抽样算法和用户体验设计等方面的设计，突出软件流程灵活控制和数据可视化设计两大特色，满足用户对软件的易用性和体验度的需求。 |
| Contact person 所内联系人 | 王延颋 |